Sultan Ibrahim kết hôn với Raja Zarith Sofia vào năm 1982, bà là con gái của Sultan Idris Shah II của Perak.[21][22] Họ có sáu người con:

• Tunku Ismail Idris Abdul Majid Abu Bakar (sinh ngày 30 tháng 6 năm 1984). Ông được Sultan Iskandar phong làm Raja Muda vào tháng 4 năm 2006,[23] và được trở thành Tunku Mahkota khi Sultan Ibrahim kế vị.
• Tunku Aminah Maimunah Iskandariah (sinh khoảng năm 1987)[24]
• Tunku Idris (sinh khoảng năm 1988)[25] Tunku Temenggong của Johor. Ông được bổ nhiệm là nhiếp chính của Johor khi khuyết diện cha và Raja Muda vào ngày 29 tháng 9 năm 2012.[26]
• Tunku Abdul Jalil (sinh khoảng năm 1990) Tunku Laksamana của Johor[27]
• Tunku Abdul Rahman (sinh khoảng năm 1993)[28] Tunku Panglima của Johor[27]
• Tunku Abu Bakar (sinh khoảng 2001) Tunku Putera của Johor[27]